A biztonságba helyezési terv alapján a biztonságba helyezési fázisban történik a hidrogeológiai védőterület kijelölése, ami a jogerős vízjogi határozat alapján a szükséges telekkönyvi bejegyzéseket is jelenti. Ezekhez kapcsolódva történik meg azokkal a területhasználókkal való kapcsolatfelvétel, akik tulajdonát külön intézkedések érintik, valamint a korlátozások érvényre juttatása és a kártalanítások. Ebben a fázisban kezdődik meg a szennyezések felszámolása, a kármentesítés.
A biztonságba helyezési fázisban - a diagnosztikai fázisban kiépült észlelőhálózatra alapozva - kezdi meg működését az ellenőrző, megfigyelő rendszer, beleértve az észleléseket, az adatfeldolgozást, tárolást és információáramlást, valamint a rendszeres értékeléseket.
Ebben a fázisban történik a védőterületek határainak kerítésekkel és jelzőtáblákkal történő terepi kijelölése, valamint a kijelölt területek időszakos bejárásokkal történő ellenőrzése is.
A biztonságba helyezés feladatainak felelőse a vízbázis üzemeltetője, illetve az önkormányzat, továbbá mindazok, akikre a védőterületi határozat feladatot ró.
A biztonságba-helyezést követően a biztonságban-tartásról kell gondoskodni. Ennek keretében üzemi ellenőrző-figyelmeztető rendszert kell működtetni a vízbázison, hogy észlelhető legyen, ha szennyezőanyag került a vízkivétel felé tartó vízbe, lehetőleg akár évekkel az előtt, hogy elérné a vízkivételi létesítményeket, sőt a meghagyott, vagy átalakított szennyező forrásokat is állandó ellenőrzés alatt kell tartani, hogy azok az előrejelzésnek megfelelő módon hatnak-e a vízbázis vizére. Folyamatosan figyelemmel kell kísérni a védőterület egészét is, hogy nem kezdődött-e ott a vizet károsító illegális tevékenység.
Eddig 5 felszíni és 712 felszín alatti ivóvízbázis védőidomát, illetve védőterületét határozták meg vagy a meghatározás folyamatban van (a 123/1997 Korm. rendelet szerint). Ez a vízbázisok 40%-át jelenti, azonban az összkapacitáshoz viszonyítva a teljesítés közel 90%-os.
Közismert, hogy a megfelelő minőségű ivóvíz biztosítása a vízbázisvédelem mellett több úton is elérhető. Keveréssel, hígítással, vízkezeléssel, különböző víztisztítási technológiákkal, palackozott ivóvíz szolgáltatással. Azonban a természetes eredetű, tiszta ivóvíznél nincs jobb, egészségesebb, élvezetesebb.
Megfelelő minőségű ivóvízellátás hosszú távú megőrzésének a biztonság szempontjából legmegnyugtatóbb egyben a leghatékonyabb és a leggazdaságosabb módja a vízbázisvédelem.